Genkopplungs- & Rekombinationsfrequenz-Rechner
Analysiere die Genkopplung anhand von Testkreuzungsdaten. Gib die beobachtete Anzahl der Nachkommen für elterliche und rekombinante Phänotypen ein, um den Kartenabstand in Centimorgan (cM) zu berechnen.
Phänotyp-Häufigkeiten der Nachkommen
Gib die beobachtete Anzahl der elterlichen (Nicht-Crossover) und rekombinanten (Crossover) Nachkommen ein.
Elterliche Typen (Am häufigsten)
Rekombinante Typen (Am seltensten)
Kopplungsanalyse
Experten-Tipp
Wenn sich die Rekombinationsfrequenz 50 % nähert, liegen die Gene entweder auf verschiedenen Chromosomen oder sehr weit voneinander entfernt auf demselben Chromosom und verhalten sich so, als ob sie ungekoppelt wären (unabhängige Verteilung).
Methodik & Gleichungen
Formel für die Rekombinationsfrequenz
Die Rekombinationsfrequenz gibt den Prozentsatz der Crossover-Ereignisse während der Meiose an:
Centimorgan (cM)
Ein Centimorgan (cM) ist definiert als der genetische Abstand, über den 1 % der Nachkommen rekombinant sind. Daher entspricht eine Rekombinationsfrequenz von 8 % direkt einem genetischen Kartenabstand von 8 cM.
Genkopplung berechnen: Schritt-für-Schritt
Hier ist ein Berechnungsbeispiel basierend auf den beobachteten Werten von 450 und 470 elterlichen sowie 42 und 38 rekombinanten Nachkommen:
Summiere die Gesamt-Nachkommen
Addiere alle beobachteten Individuen: Gesamt = 450 + 470 + 42 + 38 = 1.000 Nachkommen.
Summiere die Rekombinanten
Addiere die Werte für die Crossover-/rekombinanten Klassen: Rekombinanten = 42 + 38 = 80 Nachkommen.
Teilen und in Prozent ausdrücken
Teile die Rekombinanten durch die Gesamtanzahl und multipliziere mit 100:
RF (%) = (80 / 1.000) × 100 = 8,0 %.
Dies entspricht direkt 8,0 cM Kartenabstand. Da 8,0 % < 50 % ist, sind die beiden Gene genetisch gekoppelt.
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